TUTORIAL APLIKASI PYMOL DALAM PEMBELAJARAN KIMIA

PyMOL merupakan sistem molekul grafis dengan tertanam interpreter Python yang dirancang untuk visualisasi real-time dan cepat generasi grafis molekul berkualitas tinggi gambar dan animasi. Itu juga dapat melakukan banyak tugas-tugas berharga lain (seperti mengedit file PDB) untuk membantu Anda dalam penelitian Anda.

Dengan menggunakan aplikasi ini kita akan dengan mudah mengetahui bentuk      molekul, Van der Walls radius, hingga mesh yang dimiliki  oleh suatu molekul.

Adapun caranya sebagai berikut:

Pertama kita harus membuka aplikasinya, akan muncul 2 tampilan yaitu Molecular Graphic System dan Pymol Viewer.

Klik toolbar build pada Molecular Graphic System , akan muncul banyak pilihan, missal kita pilih fitur Residue → Alanine.

Kemudian apabila anda ingin mengubah-ubah tampilnnya kita bisa memilih fitur-fitur yang ada di sebelah kanan, untuk mengetahui formal charge kita bisa pilih fitur L-toolbar → other properties →formal charge.

Jika ingin mengetahui Van der Walls radius tinggal pilih L-toolbar → vdw radius.

Untuk mengetahui symbols pilih L-toolbar → element symbol.

Lalu pilih S-toolbar → dots.

Dan kemudian jika ingin mengetahui mesh dan surface pilih S-toolbar→ mesh dan S-toolbar → surface.

Selanjutnya view dan kemudian Orient.

Bagaimana??

Tertarik untuk mencoba?

Selamat mencoba kawan...:)